やや大きな河川には沈水植物群落が見られる。これらの植物の種類は多く、エビモ、ホザキノフサモ、クロモ、センニンモ、ヤナギモ、ササバモなどがその場所ごとに組合せを変えて、生育し、水面下に植物群落が見え、また初夏などの花期には水面に花を広げる。また場合によってはこれらの水生植物の組合せの中に、コカナダモが侵入して繁茂し、大群落になっている場合もある。それぞれの水生植物は、一定の水質が維持されている事が生育条件の一つではあるが、厳密にはその条件については分っていない部分もある。

水質を維持することが大切であるが、その前提として河川の環境を維持し、水量などが大きく変ることが、あまりないようにすることが、この群落を保全するために必要である。地域全体の保全の中で考えるべきことである。